• Header of Imaging at Transmitting Science

Advanced Courses on Life Sciences

Curso Online En Directo – 8ª Edición

Técnicas de Análisis de Imagen: Tratamiento y Cuantificación de la Imagen Digital

Tecnicas de Analisis de Imagen Tratamiento y Cuantificacion de la Imagen Digital

INSCRIPCIÓN CERRADA

Si quieres recibir información sobre nuevas ediciones, por favor SUBSCRIBETE a nuestra Newsletter.

Resumen del curso & Programa

Es un curso fundamentalmente práctico, donde se abordará, entre otros métodos, los procedimientos básicos para el realce y la restauración de las imágenes, la eliminación del ruido de fondo de muestras procedentes de microscopía convencional y confocal, la preparación de máscaras para la cuantificación y el análisis de imagen semiautomático y la reconstrucción tridimensional a partir de secciones ópticas y cortes histológicos.

Todo el software que se utilizará en el curso será libre y se facilitará a los participantes durante el mismo (ImageJ y Fiji).

Bloque 1: Presentación del curso: Diagrama completo del flujo de trabajo en análisis de imagen

  • Concepto y finalidad del Análisis de Bio-imagen.
  • Cosas a tener en cuenta en la hora de medir.
  • Propiedades de la imagen digital: tamaño y resolución, calibrado, profundidad.
  • Espacios de color.
  • Tipo de archivos de imagen. Paletas de falso color.
  • Dimensiones de las imágenes biológicas.

Bloque 2: Hacia la selección de los objetos de interés:

  • Realce y restauración:
  • operaciones que cambian el número de píxeles,
  • descomposición del color,
  • operaciones punto a punto,
  • operaciones en el dominio espacial,
  • operaciones en el dominio de la frecuencia.
  • Segmentación
  • segmentación manual,
  • segmentación por umbrales,
  • segmentación basada en la detección de bordes,
  • segmentación basada en regiones,
  • segmentación por clustering,
  • segmentación por clasificación de píxeles (machine learning).

Bloque 3: Imagen Binaria

  • Concepto y propiedades de la imagen binaria.
  • operaciones Booleanas (AND, OR, XOR) concepto y aplicaciones.
  • Operaciones de Morfología matemática:
  • Erosión, Dilatación,
  • Apertura, Cierre,
  • Outline, Skeletonize, Analyze skeleton,
  • Fill Holes,
  • Mapa de distancias euclídeas, Ultimate Erode Points,
  • Watershed,
  • Voronoi,
  • Reconstrucción binaria.

Bloque 4: Medidas

  • ¿Qué medir?: Información espacial y espectral.
  • Medida frente a resultado.
  • Exactitud y precisión.
  • Descriptores de forma primarios y derivados.

Bloque 5: Programario de análisis de imagen.

  • ImageJ/Fiji i la importancia del Open Source.
  • Fiji: comandos simples, comandos integrados,
  • Plugins i Macros.
  • Fiji Updater

Bloque 6: Automatización: macroinstrucciones

  • Macroinstrucciones: concepto y uso.
  • El lenguaje macro en ImageJ.
  • Funciones incorporadas (Built-in MacroFunctions).
  • Anotaciones y comentarios para otros usuarios.
  • Variables: definición y uso.
  • Concatenación.
  • Vectores: definición y uso.
  • Estructuras de control (condicionales y bucles).
  • Creación y uso de cuadros de dialogo.

Graduado o Postgraduado en cualquier grado de Ciencias, conocimientos básicos de Estadística y de informática.

Ordenador portátil (Windows, Mac, Linux) y una buena conexión a internet. Es necesario el uso de cámara y auriculares.

Pertusa Grau, José Francisco (2012) Técnicas de análisis de imagen. Universitat de València. Servicio de Publicaciones Universitat de València, 352 p.

Profesorado

Jose F. Pertusa-Grau instructor for Transmitting Science

Dr. José F. Pertusa-Grau
Universitat de València
España

Jose Manuel Morante Redolat instructor for Transmitting Science

Dr. José Manuel Morante Redolat
Universitat de València
España

Fechas & Horario

13-24 de marzo, 2023

15:00-19:00  (zona horaria de Madrid)

Sesiones en línea en directo el 13, 14, 22, 23, y 24 de marzo de 15:00 a 19:00  (zona horaria de Madrid).

El resto de las horas se realizarán con ejercicios a realizar por los estudiantes entre las sesiones en directo.

Total de horas lectivas: 26

Este curso es equivalente a 1 ECTS (European Credit Transfer System). El reconocimiento de los créditos depende de cada institución.

Idioma

Español

Este curso se impartirá online

Este curso se impartirá mediante una combinación de sesiones en directo (sincrónicas) en Zoom, con ejercicios  a realizar entre las clases en directo.

Las sesiones en directo se grabarán y estarán disponibles para los participantes durante un período de tiempo limitado. Aún así se requiere la asistencia a las sesiones en vivo, ya que este curso es principalmente práctico.

Número de plazas

La capacidad del curso es de 16 participantes, que se ocuparán por estricto orden de inscripción.

Los participantes que completen el curso recibirán un certificado a la finalización del mismo.

.

Matrícula & Descuentos

  • Matrícula
  • Precio reducido (hasta el 28 de febrero, 2023):
  • 446 €
    (Instituciones Embajadoras 356.8 €)
  • Precio completo (a partir del 1 de marzo, 2023):
  • 540 €
    (Instituciones Embajadoras 432 €)
  • IVA incluido.
    Al inscribirte recibirás un email con la confirmación de tu aceptación en este curso.
    El pago no es requerido durante el proceso de inscripción.

Ofrecemos descuentos sobre la Matrícula del curso. 

Los descuentos no son acumulativos; aplicándose, en cualquier caso, el de mayor cuantía.

Ofrecemos también la posibilidad de pagar en dos plazos (contacte nos).