• Header of Imaging at Transmitting Science

Advanced Courses on Life Sciences

Curso online – 7th Edition

Técnicas de Análisis de Imagen: Tratamiento y Cuantificación de la Imagen Digital

13-17 julio, 2020

Imaging

Imaging

INSCRIPCIÓN CERRADA

Si quieres recibir información sobre nuevas ediciones, por favor SUBSCRIBETE a nuestra Newsletter.

Este curso se impartirá online: 20 horas de clase online en directo, y 10 horas de ejercicios para que el alumno realice por su cuenta. Se necesita una buena conexión a internet para seguir el curso.

Tecnicas de Analisis de Imagen Tratamiento y Cuantificacion de la Imagen DigitalResumen del curso

Dirigido a usuarios de microscopía avanzada que deseen obtener mayor rendimiento de sus equipos, mejorar la calidad de las imágenes y obtener resultados cuantitativos de las mismas.

Es un curso fundamentalmente práctico, donde se abordará, entre otros métodos, los procedimientos básicos para el realce y la restauración de las imágenes, la eliminación del ruido de fondo de muestras procedentes de microscopía convencional y confocal, la preparación de máscaras para la cuantificación y el análisis de imagen semiautomático y la reconstrucción tridimensional a partir de secciones ópticas y cortes histológicos.

Todo el software que se utilizará en el curso será libre y se facilitará a los participantes durante el mismo (ImageJ y Fiji).

REQUISITOS

Graduado o Postgraduado en cualquier grado de Ciencias, conocimientos básicos de Estadística y de informática. Ordenador portátil (Windows, Mac, Linux).

Contacto

courses@transmittingscience.com

Lugar

Este curso se impartirá online

Consulta el horario correspondiente a las clases en directo, y ten en cuenta que es GMT+1.

FECHAS

13-17 julio, 2020

Lengua

Español

Horas lectivas

30 horas online.

NÚMERO DE PLAZAS

La capacidad del curso es de 16 participantes, que se ocuparán por estricto orden de inscripción.

Los participantes que completen el curso recibirán un certificado a la finalización del mismo.

Jose F. Pertusa-Grau instructor for Transmitting Science

Dr. José F. Pertusa-Grau
Universitat de València
España

Soledad De Esteban-Trivigno Transmitting Science coordinator

Dr. Soledad De Esteban-Trivigno

Transmitting Science

Juan Vicente Berto-Mengual coordinator at Transmitting Science

Juan Vicente Bertó-Mengual
Transmitting Science

Programa

1. Métodos manuales para la obtención de medidas. Estereología. Qué medir y cómo. Estimación del área. Estimación de la longitud de un objeto. Estimación del error de la medida. Inferencia de la tercera dimensión: métodos estereológicos; cálculo de volumen, superficie y densidad de objetos en estructuras tridimensionales.


2. Análisis de imagen asistido por ordenador. La imagen analógica y la imagen digital. Conversión analógica-digital: el píxel. Convenios en análisis de imagen. Parámetros de campo y de objeto. Parámetros densitométricos. Nivel de gris: el histograma de gris. Escalado lineal. Procedimiento general en análisis de imagen asistido por ordenador.


3. Procesado de imagen (I): Operaciones punto a punto. Tablas de conversión de gris (LUT). Falso color. Alteraciones del histograma de gris: normalización y ecualización. Operaciones aritméticas entre imágenes en gris. Problemas de la manipulación de grises para la medida de parámetros.


4. Procesado de imagen (II): Operaciones de vecindad. Concepto de Kernel. Filtros de suavizado y enfatizado. Operaciones matemáticas para detectar márgenes: el operador cruzado de Roberts. Los operadores matriciales Sobel y Kirsch. Otros detectores de márgenes.

5. Segmentación. Técnicas de Segmentación: segmentación manual, segmentación por umbrales, otras técnicas de segmentación. La imagen binaria y sus propiedades.


6. Operaciones con imágenes binarias. Morfología Matemática. Algoritmos básicos: erosión, dilatación apertura, cierre. Algoritmos clásicos: Border-Kill y Hole-Fill. Reconstrucción de imágenes degradadas. Algoritmos de esqueletizado, adelgazamiento y crecimiento. Operaciones booleanas con imágenes binarias: aplicaciones. Determinación de errores en operaciones sobre imágenes binarias.


7. La imagen 3D. Series de imágenes según su procedencia: cortes seriados, microscopio confocal, imagen de tomografía. Preparación de pilas de imágenes a partir de imágenes independientes; formato del archivo de la pila de imagen. Reconstrucción de imagen 3D desde cortes ópticos y pilas de imágenes.


8. Resolución de problemas concretos: Análisis estereológico. Corrección de errores en la captación de imagen: sombreado y ruido de fondo. Medidas de parámetros densitométricos de objeto: segmentación y aplicación de máscaras. Medidas de parámetros morfométricos: segmentación, aplicación de máscaras y clasificación de objetos.

Pertusa Grau, José Francisco (2012) Técnicas de análisis de imagen. Universitat de València. Servicio de Publicaciones Universitat de València, 352 p.

Matrícula

  • Course Fee
  • Precio reducido (hasta el 30 de junio, 2020):
  • 390 € *
    (Instituciones Embajadoras 312€)
  • Precio completo (a partir del 1 de julio, 2020):
  • 490 € *
    (Instituciones Embajadoras 392 €)
  • Incluye el material del curso (IVA incluido).
    * Participantes de empresas tienen un cargo extra de 100 €.

Los participantes que pertenezcan a alguna de las instituciones embajadoras listadas AQUÍ tendrán un 20 % de descuento. Los descuentos (ver la sección de Financiación) no son acumulativos y se aplican sólo a la inscripción.

Ofrecemos la posibilidad de pagar en dos plazos (contacte con la coordinadora del curso).

Horario

  • Jueves 9 de julio:
    • 15:00-17:00: presentación del curso y comprobación de plataformas.
  • De Lunes 13 de julio a Viernes 17 de julio:
    • 10:00 a 12:00 clases en directo (GMT+1).
    • 15:00 a 17:00 clases en directo (GMT+1).

El resto del tiempo se impartirá a través de ejercicios.

Financiación

Descuentos

Los descuentos no son acumulativos; aplicándose, en cualquier caso, el de mayor cuantía.

Los antiguos participantes tendrán un 5% de descuento sobre el precio actual del curso.

Se ofrece un 20% de descuento sobre la Matrícula del curso para los miembros de algunas organizaciones (Organizaciones Embajadoras). Si le corresponde beneficiarse de este descuento, por favor indíquelo en el formulario de Inscripción (más adelante se le pedirá justificarlo).

Científicos desempleados que vivan en España, así como estudiantes de doctorado españoles que estén desarrollando su doctorado en España y no tengan beca o ayuda para la realización del mismo, podrán beneficiarse de un 40% de descuento sobre la Matrícula del curso. Si desea solicitar este descuento, por favor contacte con la coordinadora del curso. Este descuento se aplicará a un máximo de 1 participante por estricto orden de inscripción.