Curso Online En Directo – 3ª Edición
7-9 de febrero, 2024
Dirigido a usuarios de microscopía avanzada que deseen obtener mayor rendimiento de sus equipos, obtener resultados cuantitativos y automatizar los procedimientos de los mismos.
Es un curso fundamentalmente práctico, pensado especialmente para aquellos que ya tengan conocimientos básicos de análisis de imagen. No obstante, se ha previsto complementar el nivel de quien lo necesite, dedicando las sesiones iniciales al reciclado de los puntos básicos necesarios para seguir el curso con buen rendimiento.
Se parte de los procedimientos básicos para la restauración de las imágenes y la eliminación del ruido; se repasará la aplicación de las principales técnicas de segmentación, y se dedicará una especial atención a la preparación de máscaras binarias para la cuantificación y el análisis de imagen semiautomático. El núcleo del curso se centra en el estudio de las técnicas ordenadas de programación, el lenguaje de generación de macroinstrucciones de “image-J” y de las herramientas que permiten preparar rutinas ejecutables en formato “image-J-plugins“.
Todo el software que se utilizará en el curso será libre y se facilitará a los participantes durante el mismo (ImageJ y Fiji).
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BLOQUE 1: REPASO DE CONCEPTOS BÁSICOS: DISEÑO Y ETAPAS DEL WORKFLOW DE ANÁLISIS
– Concepto y objetivo del análisis de Biomagen
– Esquema de trabajo básico
– Concepto de Workflow y componentes
– Descripción general de los pasos de un workflow:
o Preprocesado: Realce y Restauración
o Segmentación
o Postprocesado e Imagen Binaria
o Selección de parámetros y medidas
BLOQUE 2: AUTOMATIZACIÓN: INTRODUCCIÓN AL LENGUAJE MACRO
– Concepto de macroinstrucción
– Código de colores del lenguaje macro
– Recorder y sintaxis
– Apertura de menús vs ejecución de comandos (parámetros de función)
– Configuración (SetOptions)
– Anotaciones
– Ventana Log
– Variables y su uso
– Vectores y su uso
– Concatenación
– Bucles, tipos y uso
BLOQUE 3: ESTRATEGIAS DE AUTOMATIZACIÓN
– Interacción con el usuario (entrada de datos y toma de decisiones booleanas)
– Gestión de ruta, carpetas y listados de ficheros
– Selección de tipos de ficheros
– Análisis de strings y trabajo con nombres de ficheros
– Trabajo con medidas (sin pasar por la tabla de resultados) (List.SetMeasurements y getValue)
– Trabajo con la tabla de resultados (entrada/Salida de datos, creación de tablas)
– Guardado en disco
– Batch mode
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Graduado o Postgraduado en cualquier grado de Ciencias, conocimientos básicos de Estadística y de informática.
Los participantes deben tener un ordenador (Windows, Mac, Linux) con una buena conexión a internet.
Se recomienda conocimientos previos de análisis de imagen.
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Pertusa Grau, José Francisco (2012) Técnicas de análisis de imagen. Universitat de València. Servicio de Publicaciones Universitat de València, 352 p.
Dr. José F. Pertusa-Grau
Universitat de València
España
Dr. José Manuel Morante Redolat
Universitat de València
España
7-9 de febrero, 2024
15:00-19:00 (zona horaria de Madrid).
Sesiones en línea en directo el 7, 8 y 9 de febrero de 15:00 a 19:00 (zona horaria de Madrid).
El resto de las horas se realizarán con ejercicios a realizar por los estudiantes entre las sesiones en directo.
Total de horas lectivas: 14
Español
Este curso se impartirá mediante una combinación de sesiones en directo (sincrónicas) en Zoom, con ejercicios a realizar entre las clases en directo.
Las sesiones en directo se grabarán y estarán disponibles para los participantes durante un período de tiempo limitado. Aún así se requiere la asistencia a las sesiones en vivo, ya que este curso es principalmente práctico.
La capacidad del curso es de 16 participantes, que se ocuparán por estricto orden de inscripción.
Los participantes que completen el curso recibirán un certificado a la finalización del mismo.
Ofrecemos descuentos sobre la Matrícula del curso.
Los descuentos no son acumulativos; aplicándose, en cualquier caso, el de mayor cuantía.
Ofrecemos también la posibilidad de pagar en dos plazos (contáctanos).
5% de Descuento - Antiguos participantes
Los antiguos participantes tendrán un 5% de descuento sobre el precio actual del curso.
20% de Descuento - Instituciones Embajadoras
Se ofrece un 20% de descuento sobre la Matrícula del curso para los miembros de Instituciones Embajadoras (Organizaciones con descuento). Si le corresponde beneficiarse de este descuento, por favor indíquelo en el formulario de Inscripción (más adelante se le pedirá justificarlo). Si deseas que tu institución sea una Institución Embajadora de Transmitting Science, contáctanos en communication@transmsittingscience.com.
40% de Descuento - Científicos sin financiación que vivan en España
Científicos desempleados que vivan en España podrán beneficiarse de un 40% de descuento sobre la Matrícula del curso. Si desea solicitar este descuento, por favor contacte nos. Este descuento se aplicará a un máximo de 1 participante por estricto orden de inscripción.
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