• Advanced Courses in Life Sciences

    Header of Ecology at Transmitting Science

Curso Online En Directo – 2ª Edición

Modelos de Distribución de Especies con Estadística Bayesiana en R

30 de enero – 3 de febrero, 2023

Las sesiones en directo se grabarán

Curso Modelos de distribución de especies con estadística bayesiana en R

INSCRIPCIÓN CERRADA

Si quieres recibir información sobre nuevas ediciones, por favor SUBSCRIBETE a nuestra Newsletter.

Los árboles de regresión aditivos bayesianos (BART, Bayesian Additive Regression Trees) son un método de aprendizaje automático o aprendizaje de máquinas (machine learning) con aplicaciones muy prometedoras en el modelado de distribución de especies basado en datos de presencia y ausencia de observaciones.

A diferencia de la mayoría de métodos, la capacidad predictiva de BART suele mostrar un buen equilibrio entre los dos aspectos principales de la evaluación de modelos: la discriminación (que implica distinguir las localidades con presencia de las demás) y la calibración (que implica que la probabilidad de presencia refleje la variación gradual en la frecuencia de ocurrencia de la especie).

Los BART generan predicciones acertadas sin sobreajustarse al ruido ni a casos particulares en los datos. En este curso se explicará:

1) Una introducción o repaso sobre modelos de nicho ecológico y modelos de distribución de especies

2) La construcción de modelos de diferente complejidad, incluyendo métodos de regresión estadística y métodos de aprendizaje de máquinas (tanto bayesianos como no bayesianos)

3) Validación cruzada y comparación de los modelos enfocando varios aspectos de su capacidad predictiva, en particular la discriminación y la calibración o fiabilidad

4) La identificación de variables relevantes, curvas y mapas de respuesta parcial, y predicciones con intervalos de confianza y niveles de incertidumbre. Las prácticas se harán en R, utilizando paquetes como ’embarcadero’, ‘fuzzySim’, ‘blockCV’ y ‘modEvA’.

Durante el curso, los participantes podrán aplicar  estas técnicas a sus propios datos de presencia de especies, o si no los tienen a datos de ejemplo que serán proporcionados por la profesora.

Día 1:

  • Introducción / repaso sobre modelos de nicho ecológico y de distribución de especies
  • Datos de distribución de especies: formatos y fuentes
  • Variables predictoras: formatos y fuentes
  • PRÁCTICA: obtención y puesta a punto de datos de presencia y variables ambientales

Día 2:

  • Definición del área de estudio y resolución espacial para el modelado
  • Datos de distribución: sólo presencia, presencia/ausencia y presencia/background
  • Métodos, paquetes y funciones para la construcción de modelos
  • PRÁCTICA: construcción de modelos con distintos métodos (GLM, GAM, Maxent, Random Forest, Boosted Regression Trees, BART)

Día 3:

  • Distintas facetas de la evaluación de modelos: discriminación y calibración
  • Medidas de evaluación de modelos
  • Validación cruzada en bloques espaciales
  • PRÁCTICA: evaluación y validación de los modelos

Día 4:

  • Importancia de las variables y selección automática
  • Intervalos de confianza e incertidumbre de las predicciones
  • Curvas y mapas de respuesta parcial
  • Cartografía del aprendizaje automático
  • Ejemplos de aplicaciones de BART a los modelos de distribución de especies
  • PRÁCTICA: importancia y selección de variables, curvas y mapas de respuesta parcial, mapas del proceso de aprendizaje automático

Día 5:

  • Presentaciones de los trabajos de los alumnos

– propuestas de mejora y desarrollo

– discusión general y perspectivas

Los participantes deben tener un ordenador con una buena conexión a internet, versiones recientes de R y RStudio, y un conjunto de paquetes R cuyas instrucciones de instalación se enviarán antes del curso.

Se requiere conocimiento básico de R.

A. Marcia Barbosa instructor for Transmitting Science

Dra. A. Márcia Barbosa
Consultoría
Portugal

Fechas & Horario

30 de enero – 3 de febrero, 2023

15:00-19:00 (zona horaria de Madrid)

Sesiones en línea en directo del lunes a viernes de 15:00 a 19:00 (zona horaria de Madrid).

El resto del tiempo (unas 4 horas adicionales al día) se impartirá a través de ejercicios a realizar por los alumnos fuera de las sesiones en directo, con scripts preparados.

La profesora estará disponible cada día de 9:00 a 23:00  para consultas telemáticas sobre los mismos.

Es importante tener en cuenta que para poder seguir el curso se necesita una dedicación de 7 horas al día.

Total de horas lectivas: 35

Este curso es equivalente a 1 ECTS (European Credit Transfer System). El reconocimiento de los créditos depende de cada institución.

Idioma

Español

Este curso se impartirá online

Este curso se impartirá mediante una combinación de sesiones en directo (sincrónicas) en Zoom, con ejercicios  a realizar entre las clases en directo.

Las sesiones en directo se grabarán y estarán disponibles para los participantes durante un período de tiempo limitado. Aún así se requiere la asistencia a las sesiones en vivo, ya que este curso es principalmente práctico.

Plazas

La capacidad del curso es de 18 participantes, que se ocuparán por estricto orden de inscripción.

Los participantes que completen el curso recibirán un certificado a la finalización del mismo.

Matrícula & Descuentos

  • Precio de la Matrícula
  • Precio reducido (hasta el 31 de diciembre, 2022):
  • 446 €
    (Instituciones Embajadoras 356.8 €)
  • Precio completo (a partir del 1 de enero, 2023):
  • 520 €
    (Instituciones Embajadoras 416 €)
  • Precio IVA incluido.
    Al inscribirte recibirás un email con la confirmación de tu aceptación en este curso.
    El pago no se requiere durante el proceso de inscripción.

Ofrecemos descuentos sobre la Matrícula del curso. 

Los descuentos no son acumulativos; aplicándose, en cualquier caso, el de mayor cuantía.

Ofrecemos también la posibilidad de pagar en dos plazos (contáctanos).

Los antiguos participantes tendrán un 5% de descuento sobre el precio actual del curso.

Se ofrece un 20% de descuento sobre la Matrícula del curso para los miembros de Instituciones Embajadoras (Organizaciones con descuento). Si le corresponde beneficiarse de este descuento, por favor indíquelo en el formulario de Inscripción (más adelante se le pedirá justificarlo). Si deseas que tu institución sea una Institución Embajadora de Transmitting Science, contáctanos en communication@transmsittingscience.com.

Científicos desempleados que vivan en España podrán beneficiarse de un 40% de descuento sobre la Matrícula del curso. Si desea solicitar este descuento, por favor contacte nos. Este descuento se aplicará a un máximo de 1 participante por estricto orden de inscripción.